Les commandes LINUX sont pratiquement les même que sous UNIX (il existe des variantes notamment pour les options, et il convient de consulter l'aide en ligne pour connaître les spécifications de son système et de son shell de connexion). Le shell de connexion est un programme qui sert d'interface entre le noyau et l'utilisateur. C'est le shell qui est à l'écoute des commandes que peut saisir l'utilisateur. Le shell présente l'invite de commandes dès la connexion du compte de l'utilisateur en mode texte (run level 3 du fichier "/etc/inittab"). En mode graphique , l'utilisateur peut ouvrir un terminal avec les touches CTRL + ALT + F1 à F6 et F7 pour revenir au mode graphique, l'utilisateur peut également lancer une console virtuelle (une fenêtre de terminal) tout en restant à l'intérieur de l'interface graphique.